Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGM1P36871 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGM1P36871 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGM1P36871 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGM1P36871 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGM1P36871 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGM1P36871 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PGM1P36871 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGM1P36871 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms