Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT20P35900 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT20P35900 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT20P35900 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms