Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDIT3P35638 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms