Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGER4P35408 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGER4P35408 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTGER4P35408 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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