Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD34P28906 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD34P28906 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD34P28906 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD34P28906 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD34P28906 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD34P28906 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD34P28906 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD34P28906 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD34P28906 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CD34P28906 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms