Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCAP28676 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCAP28676 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCAP28676 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms