Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms