Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms