Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
APCP25054 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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APCP25054 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
APCP25054 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
APCP25054 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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APCP25054 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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APCP25054 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
APCP25054 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
APCP25054 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
APCP25054 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
APCP25054 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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APCP25054 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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APCP25054 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
APCP25054 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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APCP25054 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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APCP25054 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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