Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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