Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms