Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms