Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGF3P11487 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGF3P11487 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms