Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms