Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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