Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F13BP05160 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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F13BP05160 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
F13BP05160 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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F13BP05160 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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F13BP05160 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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F13BP05160 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
F13BP05160 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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