Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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HLA-DQB1P01920 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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HLA-DQB1P01920 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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HLA-DQB1P01920 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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HLA-DQB1P01920 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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HLA-DQB1P01920 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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HLA-DQB1P01920 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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