Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1O95273 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1O95273 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1O95273 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1O95273 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1O95273 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1O95273 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1O95273 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1O95273 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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