Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E5RI56 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E5RI56 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms