Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms