Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM247A6NEH6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms