Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP8A1Q9Y2Q0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms