Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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