Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms