Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms