Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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RDH8Q9NYR8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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RDH8Q9NYR8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RDH8Q9NYR8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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