Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms