Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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