Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF407Q9C0G0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF407Q9C0G0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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