Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC46A2Q9BY10 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A2Q9BY10 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC46A2Q9BY10 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms