Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCD2Q9BXW9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms