Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms