Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARD11Q9BXL7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms