Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DPCDQ9BVM2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DPCDQ9BVM2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms