Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
C9orf16Q9BUW7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms