Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD1Q9BUP0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms