Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF3RQ99062 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms