Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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