Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCZQ96LD1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCZQ96LD1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCZQ96LD1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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