Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms