Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms