Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms