Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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