Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms