Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMF1Q8NBK3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms