Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms