Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms