Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL2Q6ISB3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms