Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PKDCCQ504Y2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms