Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4L6Q3SYB3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms